A história da Santa Casa de Bom Despacho remonta à sua fundação em 14 de fevereiro de 1903, por iniciativa do Pe. Nicolau Angelo Del Duca, com o objetivo primordial de atender às necessidades dos mais desfavorecidos.
No período inicial, a diretoria da instituição esteve sob a liderança da Sociedade de São Vicente de Paulo, desde sua fundação até o ano de 1934. Nesse ano, a Irmandade do Perpétuo Socorro assumiu com dedicação a gestão da Santa Casa, demonstrando incansável compromisso em sua administração. Contudo, devido às dificuldades crescentes, a Irmandade transferiu a responsabilidade para a Associação de São Vicente de Paulo de Belo Horizonte, mais conhecida como as Filhas da Caridade, em 1979. Essas filhas da caridade, vindas de várias regiões do Brasil e até do exterior, incluindo a sede em Belo Horizonte, administraram a instituição com dedicação e zelo até meados de 1999.
A partir de então, a direção da Santa Casa retornou às mãos da Sociedade de São Vicente de Paulo, que enfrentou desafios significativos devido à falta de experiência em assuntos hospitalares. Essa gestão perdurou de abril de 1999 a 14 de setembro de 2001, quando, a partir de 15 de outubro do mesmo ano, a Faculdade de Ciências Médicas de Minas Gerais, através da Fundação Educacional Lucas Machado (FELUMA), assumiu a administração.
Essa transição de administração em 2001 marcou um período marcado por desafios e conflitos, persistindo até 12 de abril de 2004, quando uma nova diretoria assumiu a liderança.
A Santa Casa de Bom Despacho enfrentou, ao longo de sua história, crises financeiras que representaram grandes obstáculos para a continuidade de sua missão.
O serviço de atendimento à saúde da Santa Casa de Bom Despacho teve início em 14 de fevereiro de 1903, por iniciativa do seu fundador, o Padre Nicolau Ângelo Del Duca, conforme registrado nas atas da instituição.

A Santa Casa foi estabelecida com vínculos à Igreja Católica e com o propósito de prestar assistência médica aos doentes de toda a região centro-oeste de Minas Gerais. Ela obteve reconhecimento oficial através do Decreto Federal n° 2.536, registrado como Instituição Filantrópica, pelo Conselho Nacional do Serviço Social do Ministério da Educação e Cultura (atual Conselho Nacional da Assistência Social – CNAS).
A instituição enfrentou diversas mudanças administrativas ao longo dos anos e, nos últimos anos, está sob a gestão de sua quarta administração, que enfrentou desafios financeiros significativos para garantir a sobrevivência da Santa Casa. Atualmente, a instituição atua como um centro de referência na microrregião Centro-Oeste, no município de Bom Despacho, com a principal fonte de financiamento proveniente do Sistema Único de Saúde (SUS).